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ERCC1密碼子118單核苷酸多態性細胞轉染模型構建與功能分析

更新時間:2025-03-10      點擊次數:420

摘要

ERCC1基因密碼子118單核苷酸多態性(C118T)的細胞轉染模型,并探討其功能影響。通過定點突變技術構建野生型與突變型ERCC1表達載體,利用威尼德電穿孔儀轉染至HEK293T細胞,驗證轉染效率及SNP位點。功能分析表明,突變型ERCC1顯著降低DNA損傷修復能力并增強順鉑敏感性。結果為ERCC1基因多態性與化療耐藥性關聯研究提供模型支持。

引言

ERCC1(Excision Repair Cross-Complementation Group 1)是核苷酸切除修復(NER)通路的核心基因,其表達水平與鉑類化療藥物耐藥性密切相關。密碼子118(C118T)單核苷酸多態性(SNP)導致氨基酸由丙氨酸替換為蘇氨酸,可能影響ERCC1蛋白功能及穩定性。然而,現有研究多基于臨床樣本關聯分析,缺乏直接的功能驗證模型。


ERCC1-C118T SNP的體外細胞模型,結合基因編輯與功能分析,明確該多態性對DNA修復能力及藥物敏感性的影響,為個體化化療方案設計提供實驗依據。

實驗部分

1. 質粒構建與定點突變

采用PCR擴增技術從人基因組DNA中獲取ERCC1基因全長序列,克隆至pcDNA3.1載體。針對密碼子118(C>T)設計特異性引物,通過重疊延伸PCR引入突變。反應體系含某試劑高保真DNA聚合酶,擴增條件:98℃預變性2分鐘,30個循環(98℃ 10秒,60℃ 15秒,72℃ 2分鐘),72℃延伸5分鐘。突變質粒經威尼德分子雜交儀驗證后,送測序確認SNP位點。

2. 細胞培養與轉染

HEK293T細胞培養于含10%胎牛血清的DMEM培養基,37℃、5% CO?條件下傳代。取對數生長期細胞,接種于6孔板(密度1×10?/孔),24小時后分別轉染野生型(ERCC1-WT)與突變型(ERCC1-C118T)質粒。轉染使用某試劑脂質體法,同時設置空載體對照組。轉染后48小時,通過威尼德紫外交聯儀檢測熒光報告基因表達效率,篩選穩定轉染細胞株。

3. SNP位點功能驗證

提取轉染細胞總RNA,反轉錄為cDNA,采用qRT-PCR定量ERCC1 mRNA表達水平。蛋白水平通過Western blot檢測,一抗為某試劑ERCC1單克隆抗體(1:1000),二抗為HRP標記羊抗鼠IgG(1:5000)。使用威尼德原位雜交儀進行免疫熒光染色,觀察ERCC1蛋白亞細胞定位。

4. 功能分析

1)細胞增殖與凋亡實驗CCK-8法檢測順鉑(0-20 μM)處理48小時后細胞存活率;Annexin V-FITC/PI雙染法流式檢測凋亡率。

2)DNA損傷修復能力評估UV-C照射(20 J/m2)誘導DNA損傷,彗星實驗(單細胞凝膠電泳)定量DNA碎片化程度;γ-H2AX免疫熒光染色分析雙鏈斷裂修復效率。

結果與討論

1. 模型構建成功性驗證
測序結果顯示,突變型質粒C118T位點匹配設計。Western blot證實轉染細胞中ERCC1蛋白表達量顯著高于對照組(P<0.01),且突變型蛋白分子量無顯著差異。

2. SNP對DNA修復功能的影響
彗星實驗顯示,突變型ERCC1細胞在UV照射后尾矩較野生型增加35%(P<0.05),表明DNA修復能力下降。γ-H2AX焦點數量在突變型細胞中持續升高至24小時,而野生型在12小時即顯著減少。

3. 順鉑敏感性差異
突變型細胞經10 μM順鉑處理后,存活率較野生型降低42%(P<0.01),凋亡率增加2.3倍(P<0.001)。提示C118T多態性可能通過削弱NER功能增強化療藥物毒性。

結論

ERCC1-C118T SNP細胞模型,證實該位點突變導致DNA損傷修復能力下降及順鉑敏感性升高。此模型為ERCC1多態性機制研究及臨床化療療效預測提供了可靠工具。

參考文獻

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